MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 86395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021040	ATT	3	9	8	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021040	TGA	2	6	52	57	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021040	GAA	2	6	59	64	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021040	TAT	2	6	71	76	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021040	TTTTG	2	10	126	135	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021040	ATT	2	6	150	155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021040	TTATGG	2	12	195	206	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021040	AT	3	6	256	261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021040	A	6	6	335	340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021040	AT	3	6	357	362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021040	A	6	6	365	370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021040	AGT	2	6	398	403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021040	A	6	6	404	409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021040	T	6	6	446	451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021040	CAA	2	6	463	468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021040	GAT	2	6	487	492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021040	TA	4	8	504	511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021040	ATTT	2	8	516	523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021040	ATA	2	6	526	531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021040	TATT	2	8	546	553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021040	TAG	2	6	580	585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021040	GAA	2	6	594	599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021040	AAT	2	6	604	609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021040	TGA	2	6	630	635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201825
25	NC_021040	TGC	2	6	668	673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201825
26	NC_021040	CAAAT	2	10	728	737	60 %	20 %	0 %	20 %	479201825
27	NC_021040	GAA	2	6	787	792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201825
28	NC_021040	GAAA	2	8	822	829	75 %	0 %	25 %	0 %	479201825
29	NC_021040	GAA	2	6	868	873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201825
30	NC_021040	TAG	2	6	989	994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201825
31	NC_021040	AAACTG	2	12	1048	1059	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479201825
32	NC_021040	GAA	2	6	1162	1167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201825
33	NC_021040	TGT	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201825
34	NC_021040	A	6	6	1229	1234	100 %	0 %	0 %	0 %	479201825
35	NC_021040	TAT	2	6	1245	1250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201825
36	NC_021040	AGA	2	6	1308	1313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201825
37	NC_021040	TAAA	2	8	1316	1323	75 %	25 %	0 %	0 %	479201825
38	NC_021040	AGG	2	6	1343	1348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201825
39	NC_021040	TAT	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201826
40	NC_021040	TAA	2	6	1399	1404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201826
41	NC_021040	ATT	2	6	1412	1417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201826
42	NC_021040	AGT	2	6	1446	1451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201826
43	NC_021040	TA	3	6	1465	1470	50 %	50 %	0 %	0 %	479201826
44	NC_021040	TAG	2	6	1540	1545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201826
45	NC_021040	TAT	2	6	1584	1589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201826
46	NC_021040	TAT	2	6	1616	1621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201826
47	NC_021040	TGTC	2	8	1648	1655	0 %	50 %	25 %	25 %	479201826
48	NC_021040	A	6	6	1709	1714	100 %	0 %	0 %	0 %	479201826
49	NC_021040	TGAA	2	8	1717	1724	50 %	25 %	25 %	0 %	479201826
50	NC_021040	T	7	7	1771	1777	0 %	100 %	0 %	0 %	479201826
51	NC_021040	A	7	7	1806	1812	100 %	0 %	0 %	0 %	479201826
52	NC_021040	CAT	2	6	1841	1846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201826
53	NC_021040	GAA	2	6	1914	1919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201826
54	NC_021040	ATT	2	6	1921	1926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201826
55	NC_021040	TG	3	6	1927	1932	0 %	50 %	50 %	0 %	479201826
56	NC_021040	AGC	2	6	2035	2040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201826
57	NC_021040	A	6	6	2078	2083	100 %	0 %	0 %	0 %	479201826
58	NC_021040	ATG	2	6	2110	2115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201826
59	NC_021040	A	6	6	2164	2169	100 %	0 %	0 %	0 %	479201826
60	NC_021040	CAA	2	6	2185	2190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201826
61	NC_021040	AG	3	6	2196	2201	50 %	0 %	50 %	0 %	479201826
62	NC_021040	TTG	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201826
63	NC_021040	CTT	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201826
64	NC_021040	GA	3	6	2282	2287	50 %	0 %	50 %	0 %	479201826
65	NC_021040	AGAT	2	8	2311	2318	50 %	25 %	25 %	0 %	479201826
66	NC_021040	TGAATT	2	12	2323	2334	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479201826
67	NC_021040	TTA	2	6	2373	2378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201826
68	NC_021040	AT	3	6	2420	2425	50 %	50 %	0 %	0 %	479201826
69	NC_021040	TCATA	2	10	2442	2451	40 %	40 %	0 %	20 %	479201826
70	NC_021040	GAT	2	6	2453	2458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201826
71	NC_021040	AAT	2	6	2475	2480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201826
72	NC_021040	A	7	7	2528	2534	100 %	0 %	0 %	0 %	479201826
73	NC_021040	TGG	2	6	2535	2540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201826
74	NC_021040	CTG	2	6	2548	2553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201826
75	NC_021040	A	7	7	2571	2577	100 %	0 %	0 %	0 %	479201826
76	NC_021040	ATG	2	6	2579	2584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201826
77	NC_021040	GAA	2	6	2598	2603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021040	AAAT	2	8	2610	2617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021040	TGC	2	6	2619	2624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021040	T	7	7	2664	2670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021040	A	7	7	2692	2698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021040	GT	3	6	2736	2741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021040	A	7	7	2748	2754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021040	GAT	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021040	A	6	6	2774	2779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021040	ATG	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021040	AC	3	6	2829	2834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021040	TGC	2	6	2874	2879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021040	A	6	6	2916	2921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021040	GGA	2	6	2938	2943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201827
91	NC_021040	GAA	2	6	2953	2958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201827
92	NC_021040	ATA	2	6	2969	2974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201827
93	NC_021040	ATG	3	9	2984	2992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201827
94	NC_021040	TGA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201827
95	NC_021040	CAG	2	6	3132	3137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201827
96	NC_021040	ATG	2	6	3237	3242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201827
97	NC_021040	CAA	2	6	3264	3269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201827
98	NC_021040	GTT	2	6	3329	3334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201827
99	NC_021040	AAT	2	6	3403	3408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201827
100	NC_021040	TAAAA	2	10	3414	3423	80 %	20 %	0 %	0 %	479201827
101	NC_021040	A	6	6	3420	3425	100 %	0 %	0 %	0 %	479201827
102	NC_021040	GT	3	6	3431	3436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021040	ATA	2	6	3437	3442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021040	N	915	915	3495	4409	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021040	ATA	2	6	4431	4436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021040	GGA	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021040	TTTAA	2	10	4514	4523	40 %	60 %	0 %	0 %	479201828
108	NC_021040	ATAA	2	8	4535	4542	75 %	25 %	0 %	0 %	479201828
109	NC_021040	AAT	2	6	4543	4548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201828
110	NC_021040	GCA	2	6	4601	4606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201828
111	NC_021040	CAT	2	6	4611	4616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201828
112	NC_021040	CAT	2	6	4629	4634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201828
113	NC_021040	AAG	2	6	4731	4736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201828
114	NC_021040	GGA	2	6	4769	4774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201828
115	NC_021040	TTACAA	2	12	4800	4811	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479201828
116	NC_021040	GTG	2	6	4818	4823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201828
117	NC_021040	AGTT	2	8	4834	4841	25 %	50 %	25 %	0 %	479201828
118	NC_021040	CAAC	2	8	4863	4870	50 %	0 %	0 %	50 %	479201828
119	NC_021040	AGC	2	6	4888	4893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201828
120	NC_021040	AGA	2	6	5008	5013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201828
121	NC_021040	AAT	2	6	5066	5071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021040	GTT	2	6	5125	5130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021040	TAA	2	6	5169	5174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021040	A	7	7	5173	5179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021040	GTA	2	6	5183	5188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021040	TTG	2	6	5198	5203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021040	TTA	2	6	5206	5211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021040	AT	3	6	5269	5274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021040	A	7	7	5277	5283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021040	A	7	7	5288	5294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021040	TATAA	2	10	5299	5308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021040	A	6	6	5310	5315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021040	GTT	3	9	5319	5327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021040	A	6	6	5347	5352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021040	TAT	2	6	5366	5371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021040	TAA	2	6	5374	5379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021040	TAG	2	6	5383	5388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021040	CTG	2	6	5390	5395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021040	TAAA	2	8	5399	5406	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021040	AAG	2	6	5432	5437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201829
141	NC_021040	AGAGAT	2	12	5485	5496	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479201829
142	NC_021040	ATA	2	6	5514	5519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201829
143	NC_021040	ATT	2	6	5615	5620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201829
144	NC_021040	ATT	2	6	5651	5656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201829
145	NC_021040	AATAG	2	10	5669	5678	60 %	20 %	20 %	0 %	479201829
146	NC_021040	ACA	2	6	5689	5694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201829
147	NC_021040	AGA	2	6	5713	5718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201829
148	NC_021040	AATTG	2	10	5719	5728	40 %	40 %	20 %	0 %	479201829
149	NC_021040	AT	3	6	5852	5857	50 %	50 %	0 %	0 %	479201829
150	NC_021040	GTT	2	6	5858	5863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201829
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153	NC_021040	ATTTA	2	10	6003	6012	40 %	60 %	0 %	0 %	479201829
154	NC_021040	TAAA	2	8	6126	6133	75 %	25 %	0 %	0 %	479201829
155	NC_021040	ATT	2	6	6159	6164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201829
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157	NC_021040	T	7	7	6213	6219	0 %	100 %	0 %	0 %	479201829
158	NC_021040	AGT	2	6	6235	6240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201829
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160	NC_021040	GAA	2	6	6325	6330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_021040	ACA	2	6	6355	6360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_021040	A	7	7	6379	6385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021040	GTTT	2	8	6394	6401	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021040	TGT	2	6	6402	6407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_021040	AT	3	6	6423	6428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_021040	ATA	2	6	6485	6490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021040	TAGG	2	8	6561	6568	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021040	AAAATT	2	12	6600	6611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_021040	T	7	7	6678	6684	0 %	100 %	0 %	0 %	479201830
172	NC_021040	AT	3	6	6734	6739	50 %	50 %	0 %	0 %	479201830
173	NC_021040	GAT	2	6	6754	6759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201830
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176	NC_021040	A	7	7	6814	6820	100 %	0 %	0 %	0 %	479201830
177	NC_021040	A	6	6	6834	6839	100 %	0 %	0 %	0 %	479201830
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186	NC_021040	GGT	2	6	7162	7167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201832
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189	NC_021040	GTT	2	6	7319	7324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201832
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200	NC_021040	A	6	6	7620	7625	100 %	0 %	0 %	0 %	479201832
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202	NC_021040	A	6	6	7682	7687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_021040	ATT	2	6	10147	10152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201836
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272	NC_021040	A	6	6	10385	10390	100 %	0 %	0 %	0 %	479201836
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277	NC_021040	T	6	6	10612	10617	0 %	100 %	0 %	0 %	479201837
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279	NC_021040	ATAA	2	8	10723	10730	75 %	25 %	0 %	0 %	479201837
280	NC_021040	ATA	2	6	10824	10829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_021040	N	1265	1265	10831	12095	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_021040	AGAAA	2	10	12108	12117	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_021040	ATCAA	2	10	12186	12195	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
285	NC_021040	TAT	2	6	12196	12201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_021040	TA	3	6	12234	12239	50 %	50 %	0 %	0 %	479201838
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412	NC_021040	AT	3	6	18334	18339	50 %	50 %	0 %	0 %	479201844
413	NC_021040	CGG	2	6	18345	18350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201844
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428	NC_021040	AATA	2	8	19046	19053	75 %	25 %	0 %	0 %	479201844
429	NC_021040	CAA	2	6	19072	19077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201844
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433	NC_021040	A	6	6	19180	19185	100 %	0 %	0 %	0 %	479201844
434	NC_021040	AG	3	6	19188	19193	50 %	0 %	50 %	0 %	479201844
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437	NC_021040	AT	3	6	19319	19324	50 %	50 %	0 %	0 %	479201845
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441	NC_021040	TTG	2	6	19456	19461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201845
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443	NC_021040	GGT	2	6	19596	19601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201845
444	NC_021040	CA	3	6	19677	19682	50 %	0 %	0 %	50 %	479201845
445	NC_021040	ATT	2	6	19758	19763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201845
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452	NC_021040	TAT	2	6	20090	20095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201845
453	NC_021040	ATT	2	6	20105	20110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201845
454	NC_021040	A	7	7	20132	20138	100 %	0 %	0 %	0 %	479201845
455	NC_021040	TAT	2	6	20181	20186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201845
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461	NC_021040	CAG	2	6	20450	20455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201845
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471	NC_021040	A	6	6	20685	20690	100 %	0 %	0 %	0 %	479201845
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473	NC_021040	GATG	2	8	20757	20764	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_021040	A	7	7	21005	21011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_021040	GA	3	6	21102	21107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
481	NC_021040	TGA	2	6	21150	21155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
482	NC_021040	GAT	2	6	21184	21189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
483	NC_021040	GCA	2	6	21204	21209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
484	NC_021040	A	6	6	21252	21257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_021040	AGG	2	6	21274	21279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_021040	T	6	6	22006	22011	0 %	100 %	0 %	0 %	479201847

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